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產(chǎn)品名稱： RM 8375 測(cè)序性能評(píng)估的微生物基因組DNA

英文名稱：Microbial Genomic DNA Standards for Sequencing Performance Assessment(MG-001, MG-002, MG-003, MG-004)

品牌：NIST

規(guī)格：4 vials, 1 each

運(yùn)輸信息：干冰

RM 8375 微生物基因組DNA在用于微生物全基因組測(cè)序的驗(yàn)證、優(yōu)化、過程評(píng)估和性能評(píng)估。特別注意評(píng)估基因組序列。該材料旨在幫助評(píng)估高通量微生物 DNA 測(cè)序方法的性能。該基因組 DNA 已從細(xì)胞培養(yǎng)物中提取。因?yàn)?RM 是提取的 DNA，所以它不評(píng)估 DNA 提取等分析前步驟。然而，它確實(shí)對(duì)測(cè)序文庫制備、測(cè)序機(jī)器、堿基調(diào)用算法和隨后的生物信息學(xué)分析提出了挑戰(zhàn)。此 RM 并非旨在評(píng)估其他生物信息學(xué)步驟，例如菌株鑒定、系統(tǒng)發(fā)育分析或基因組注釋。基因組 DNA 的純度被評(píng)估為適合這些目的。

RM 8375 的一個(gè)單元由四個(gè)小瓶組成。每個(gè)小瓶包含不同的微生物基因組 DNA 樣本（MG-001 鼠傷寒沙門.氏菌 LT2、MG-002 金黃色葡萄球.菌、MG-003 銅綠假單胞菌和 MG-004 產(chǎn)孢梭菌）。

儲(chǔ)存和使用說明

儲(chǔ)存：

RM 8375 微生物基因組DNA 在 NIST 的 –20 °C 溫度下儲(chǔ)存，但將與冷凍包裝一起運(yùn)輸，并且可能不會(huì)冷凍到達(dá)。收到后，RM 8375 應(yīng)在 –20 °C 的黑暗中長期儲(chǔ)存，或在 4 °C 的黑暗中短期儲(chǔ)存（如果使用時(shí)間可能在大約 8 周內(nèi)）。

用途：

建議使用基因組序列來評(píng)估變異調(diào)用的準(zhǔn)確性，而不是基因組組裝，因?yàn)檎粶y(cè)量方法對(duì)基因組序列結(jié)構(gòu)存在分歧，并且無法解決差異。由于與用于評(píng)估堿基調(diào)用準(zhǔn)確性的方法相關(guān)的復(fù)雜性以及基因組序列中的潛在錯(cuò)誤，強(qiáng)烈建議用戶手動(dòng)檢查具有高堿基調(diào)用錯(cuò)誤率的推定區(qū)域周圍的對(duì)齊讀數(shù)。參考文獻(xiàn) 3 概述了評(píng)估微生物基因組中變異調(diào)用的最佳實(shí)踐。

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