氣相色譜儀柱溫低有利于分配，有利于組分的分離；但柱溫過低，被測組分可能在柱中冷凝，或者傳質阻力增加，使色譜峰擴張，甚至拖尾。柱溫高，雖有利于傳質，但分配系數變小不利于分離。一般通過實驗選擇*柱溫。原則是：使物質既分離*，又不使峰形擴張、拖尾。柱溫一般選各組分沸點平均溫度或稍低些。
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