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一：柱長度的選擇
      分辨率與柱長的平方根成正比。在其他條件不變的情況下,為取得加倍的分辨率需有4倍的柱長。較短的柱子適于較簡單的樣品,尤其是由那些在結構、極性和揮發性上相差較大的組分組成的樣品。
一般來說，15m的短柱用于快速分離較簡單的樣品，也適于掃描分析；
             30m的色譜柱是的柱長，大多數分析在此長度的柱子上完成；
             50m、60m或更長的色譜柱用于分離比較復雜的樣品。
             應該注意，柱長增加，分析時間也相應的增加。
二：柱內徑的選擇
         柱內徑直接影響柱子的效率、保留特性和樣品容量。小口徑柱比大口徑柱有更高的柱效，但柱容量更小。
         0.25mm：具有較高的柱效，柱容量較低。分離復雜樣品較好。
         0.32mm：柱效稍低于0.25mm的色譜柱，但柱容量約高60%。
         0.53mm：具有類似于填充柱的柱容量，可用于分流進樣，也可用于不分流進樣。
         當進行痕量分析時，選擇大口徑毛細管柱較為合適。
三：液膜厚度的選擇
       液膜厚度影響柱子的保留特性和柱容量。厚度增加，保留時間也增加。
       0.1-0.2μm：薄液膜厚度的毛細管柱比厚液膜的毛細管柱洗脫組分快，所需柱溫度低，且高溫下柱流失較小，適用高沸點的化合物的分析。
      0.25-0.5μm：常用的液膜厚度。
      0.6-5.0μm：厚液膜，對分析低沸點的化合物較為有利。