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NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫

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NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫旨在用作使用體外轉錄 (IVT) 進行核糖核酸 (RNA) 對照合成的模板。

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NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫旨在用作使用體外轉錄 (IVT) 進行核糖核酸 (RNA) 對照合成的模板。這些 RNA 對照旨在用作外部對照或“加標”對照,通過對基因表達測量的技術性能進行定量評估來支持基因表達測定的可信度。

一個 SRM 單元包含 96 個不同的 0.5 mL 聚丙烯管,其中通過吸光度 (A260) 測量,每個脫水質粒脫氧核糖核酸 (DNA) 約為 10 µg。每個試管都含有質粒 DNA,其具有*的模板序列,用于不同的外部 RNA 對照。這些控制是與外部 RNA 控制聯盟 (ERCC) 合作開發的。


NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫這些模板可以很容易地用于制作 RNA 控制(參見圖 1)。根據轉錄的鏈,對照將模擬“有義”或“反義”真核信使 RNA (mRNA)。當用于制造有義對照 RNA 時,每個對照在 3' 端將有一個標稱的 24 個核苷酸 (nt) 多聚腺苷酸 (polyA) 片段。由它們產生的 DNA 模板和 RNA 轉錄本在圖 2 和圖 3 中進行了注釋和描述。對照序列范圍從 273 nt 到 2022 nt,GC 分數 (1) 有兩種群體分布,一種以 35% GC 為中心,另一種以 47% 為中心。

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