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分子生物學是在分子水平研究蛋白質、核酸等生物大分子結構與功能的學科，是生物學的前沿領域。分子生物學的研究需要對生物大分子進行檢測，常用的儀器包括PCR儀、核酸提取儀等。除了專門的分子生物學儀器，通用的化學分析儀器也在分子生物學中有廣泛的應用，比如紫外分光光度計。
紫外分光光度計在分子生物學中主要有以下幾點應用：
1.蛋白質含量測定
(1)直接定量法：
利用紫外分光光度計直接定量檢測蛋白質含量是利用蛋白質含有的*和*在紫外光區280 nm處具有大吸收的特征，根據該波長的吸光度與蛋白質濃度成正比的關系測定其含量。
直接定量法適合測試較純凈、成分相對單一的蛋白質。特點在于快速簡便，缺點包括易受到平行物質如DNA的干擾、敏感度差、要求蛋白的濃度較高等。
(2)比色法：蛋白質的組成成分氨基酸與外加的顯色基團或染料反應，產生有色物質。有色物的濃度與氨基酸的數量相關，從而反映蛋白質濃度。常見方法包括BCA、Bradford、Lowry等幾種。
2.核酸濃度測定和純度判定
核酸的大吸收波長是260 nm，蛋白質的大吸收波長是280 nm。在波長260 nm的紫外線下，1 OD值光密度相當于約50 μg/mL雙鏈DNA，約40 μg/mL單鏈DNA或RNA。通過OD260與OD280的比值還可初步判斷核酸的純度，純DNA和RNA樣品的0D260/280分別為1.8和2.0，若樣品中有蛋白質或酚的污染，比值將低于此值。
紫外分光光度計一般只能測定質量濃度大于0.25 μg/mL的核酸濃度。
3.細菌密度測定
通常情況下，根據經驗和目測推斷細菌的生長密度和生長期，而OD600是用來檢測細菌濃度的重要指標，是追蹤液體培養物中微生物生長的標準方法。實驗中以未加菌液的培養液作為空白液，再定量培養后的含菌培養液。注意受試的樣品不能離心，要保持細菌懸浮狀。
紫外分光光度法是基礎的光譜分析方法，根據被測量物質分子對紫外-可見波段范圍單色輻射的吸收或反射強度來進行物質的定量、定性或結構分析。紫外分光光度法的應用很廣泛，可用于化學、材料、生物、醫學、食品、環境等領域。分子生物學中的應用是指其中的一小部分。
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