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重金屬的污染主要來源工業污染，其次是交通污染和生活垃圾污染。各種污染物經過自然作用進入水體造成水體污染。
1、工業污染
工業水污染主要來自造紙業、冶金工業、化學工業以及采礦業等。而在一些城市和農村水域周圍的農產品加工和食品工業，如釀酒、制革、印染等行業，也往往是水體中化學需氧量和生物需氧量的主要來源。另外，工業生產過程中產生的其他廢棄物進入水體也會造成大量的水污染，如大氣污染，最后可能以酸雨的形式污染水體。
2、生活污染
生活水污染主要來源于人類日常活動所產生的污水沒有經過合理地處理就排放造成的。我國城市污水的集中處理率僅為 57.1%人類所產生的生活污水逐年增加，所占比例持續升高。
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