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不僅地球擁有磁場，人體也可以產生微弱的磁場，磁場的變化與人體的健康情況息息相關。隨著弱磁檢測技術的發展，利用高靈敏度磁力儀檢測人體的磁場變化也成為臨床診斷的重要輔助方式。在醫療領域較為常見的是腦磁和心磁。
腦磁
人體神經信號的傳遞主要依靠電壓改變產生的電脈沖，根據電磁效應，當電脈沖沿著神經元的軸突傳播時會產生非常微弱的磁場。人體顱內腦神經組織帶電粒子的遷移會在局部產生電流。造成局部磁場變化。還可通過刺激腦部神經組織引起磁場的變化，例如采用聲信號(聽覺誘發腦磁反應)，光信號(視覺誘發腦磁反應)或電信號(體表感覺誘發腦磁反應)進行刺激。用超導磁力儀記錄這種隨時間變化的磁場變化，可以用于癲癇病灶的定位診斷，以及腦梗塞、腦溢血、精神病和心理障礙等疾病的診斷。
心磁
心臟的跳動伴隨著激活電流的產生，激活電流在周圍產生磁場，磁場的變化可以反應心臟的健康狀況。由于傳統的心電圖只能測量體表不等勢兩點的電位差，而體表的電勢差往往不能推算出體內心電電流的準確分布，因此需要接觸式測量。而采用高溫超導磁力儀進行心磁測量則可以實現非接觸測量，并且測量準確，可以對心臟損傷部位進行定位。目前，已經用于心臟疾病的診斷，如心肌缺血、冠心病、心律失常和胎兒心臟疾病檢測等。
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