美國國家生物標準與控制研究所(NIBSC)的最新研究證實,在廢水樣品中發現的冠狀病毒Δ亞型AY.4.2的頻率越來越高。
自大流行爆發以來,NIBSC研究所的科學家一直在分析倫敦一家污水處理廠的樣本,并且先前已經表明,環境監測可用于測量病毒傳播水平并主動識別令人擔憂的新變體。
NIBSC通過大流行觀察到廢水樣本中變異優勢的轉變,密切反映了臨床樣本的測序結果。2020年3月至4月,在廢水樣本中第一次觀察到變種D614在大流行的頭幾個月內取代了全球原來的武漢毒株。.2020年11月10日,在樣本中第一次發現了一種新的更具傳染性的α變體,然后在2021年1月底之前頻率迅速增加,成為主要變體。這種α變體后來被各種具有免疫逃逸特性的譜系所取代,導致病毒傳播水平的增加。Delta變體是其中最成功的,自2021年6月初以來一直占據主導地位(圖1A)。
Figure 1.(A)在倫敦污水處理廠收集的廢水樣本中鑒定的SARS-CoV-2變異的分數,基于對病毒RNA基因組中關鍵尖峰基因突變的定量。(B)廢水樣品中SARS-CoV-2 Δ亞變體AY.4.2與臨床樣品(黑線)的分數相比,基于對病毒RNA基因組中Y145H尖峰基因突變的定量。顯示了每個采樣日期的重復序列的平均值 (n=12–20)。誤差線表示均值的標準誤差。數據來源:NIBSC內部數據庫2021年10月。圖1B中提到的臨床數據來自英國HHSA關注的SARS-CoV-2變體和在英國正在研究的變體。技術簡報 26.衛生和社會護理部,2021年。
最近的結果表明,NIBSC的科學家已經能夠檢測到從7月初開始存在于污水中的最新Delta亞變體AY.4.2,然后穩步增加并達到21個樣本中病毒序列的8%左右。
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